La limitation de la souffrance animale et le respect de la vie conduisent à limiter le recours à l'expérimentation animale et à développer des méthodes de substitution. Cette situation concerne la recherche scientifique cognitive, appliquée à la médecine humaine, ou aux productions animales.
Les contraintes que l'élevage moderne impose aux animaux sont l'objet de débats. Ceci est particulièrement vrai dans le cas de l'élevage intensif (veaux de boucherie, porcins, volailles), tout au long de la chaîne de production: conditions d'entretien, manipulation (dont transport), abattage. Ceci conduit à développer les recherches portant sur des systèmes d'élevage assurant le bien-être des animaux.
Il s'agit d'examiner les aspects philosophiques, éthiques, réglementaires, scientifiques (définition, méthodes d'étude du bien-être, conséquences des stress sur la physiologie) et technologiques de ces contraintes: conséquences sur les processus de production (systèmes de production, modes de conduite, équipements) et la qualité des produits animaux.